Все о геологии

Подскажите, никак не могу найти подходящий софт для создания 3d разреза. У меня имеются данный со скважин и есть данные по рельефу (могу сделать 3d модель поверхности рельефа)

Некорректный вопрос.
Разрез просто не может быть 3d, поскольку это всегда двумерное изображение.
Получить в 3d можно только разрез трехмерной модели, например каркасной модели рудного тела и т.д.
Вопрос же автоматизированного построения плоскостного разреза по геолкарте не решен до сих пор, поскольку требует обязательного участия собственно исполнителя и не сводится к набору формализованных правил.
Большинство горно-геологического софта (микромайн, гемс, датамайн и пр.) позволяют строить двумерные разрезы по данным опробования скважин при использовании ЦМП или каркасных моделей, но большую часть придется построить "ручками".
ГИС системы тоже имеют ряд плагинов для построения разрезов.
В частности, можете посмотреть Discover (Encom Pty.) - плагин для MapInfo или Vertical Mapper. Или у Голденсофтваре есть Стратер для скважин.
Но опять же - большую часть работы придется делать вручную.

Можно в Петреле или Роксаре попробовать

Хорошая программа, которая позволяет это сделать, K-MINE http://kai.com.ua/razrabotki/gis-k-mine. На картинке показан пример построения объемных 3D разрезов по набору опробованных скважин. При этом профильные линии могут располагаться абсолютно в любом направлении, могут быть как прямыми, так и ломаными. Также удобно, что построенный разрез является набором элементарных объектов, что позволяет внести в него коррективы на основе своего опыта и знаний о месторождении. Можно легко совместить разрезы с маркшейдерскими данными о поверхности, так как это все строится в единой системе координат.